我校现有临床医学（临床医学硕士学术学位、临床医学硕士专业学位）、基础医学、药学5个硕士学位一级学科点，有肿瘤学、内科学、神经病学、影像医学与核医学、外科学、眼科学等20多个专业方向招收硕士研究生。2012年作为临床医学的二级学科，获得护理学硕士学位授权点，招收了部分护理硕士生。其中，河南省卫生厅医学临床重点专科五个：肿瘤科、心血管内科、呼吸与危重症学科、神经外科、神经内科；河南省高校重点学科三个：肿瘤学、内科学、神经外科学；洛阳市医学重点专科五个：神经内科、显微外科、烧伤整形科、普外科、血液科。